为防止系统交叉污染，美国FDA《高纯水检查指南》建议换热器可采用如下两种方法，第一，采用双板管式设计（DTS，double-tube sheet）；第二，连续监测两侧压差，并保证洁净端压力始终高于非洁净端。采用双板管式设计为目前制药用水系统用换热器的主流方式，如多效蒸馏水机的预热器与主蒸发柱、储存与分配系统用换热器及用点降温用换热器等，图1是一个典型的双板管式换热器设计原理图，在两块板片之间会有方便观察的泄漏检测口，在管与管板连接的位置发生泄漏的情况下，泄漏直接通向大气而非进入工艺流中。然而，需要注意这一设计特性不会解决因管路故障产生的相关问题。如果能够确保较高纯度的流体始终具有相对更高的压力，例如多效蒸馏水机的二效与末效之间，也可以使用单管板换热器，在这些蒸发器中，多效蒸馏水机的设计决定纯蒸汽是否将处于较高压力状态。

管壳式换热器采用液压胀接与自动焊接技术相结合，最大限度地保证工艺流程的安全性，部分供应商也能实现双胀接技术。管壳式换热器在封头两端各有一个符合FDA标准的O型圈, 易于维修更换备件。密封圈材质通常为EPDM, Silicon、 Vition与Teflon，温度均能达到250℃。管程换热内管采用8x1、10x1、12x1等不同规格的无缝钢管，壳程也采用不锈钢钢管作为套管，冷热流体分别在内管和套管环隙中流过的同时进行传热，冷热流体各走各的通道，不相混合，彻底避免交叉污染。